El Comité Ejecutivo, integrado por 25 miembros de iglesias de cada región del mundo. Se reúne dos veces al año para realizar el seguimiento del trabajo en curso, supervisar el presupuesto y tratar aquellos asuntos relacionados con la política que le haya remitido el Comité Central.
El Comité Central actúa como principal órgano rector del CMI hasta la siguiente asamblea, reuniéndose cada dos años. Tiene la responsabilidad de la aplicación de las políticas adoptadas por la asamblea, examinar y supervisar los programas del CMI y su presupuesto.
