Dans le contexte de la mondialisation économique, de l'évolution rapide des technologies de l'information, des menaces sur la paix et du multilatéralisme, le COE, par l'entremise de la Commission des Eglises pour les affaires internationales (CEAI), veille à ce que les voix des Eglises et des organisations oecuméniques soient prises en compte par les gouvernements et les organisations intergouvernementales − Nations Unies, institutions financières internationales, Cour pénale internationale, etc.

Elle le fait en rassemblant les Eglises et le mouvement oecuménique pour qu'ils s'expriment, dans une optique éthique et théologique, sur les questions sociales, économiques et politiques. Elle offre un forum où les Eglises peuvent communiquer leurs expériences aux institutions des Nations Unies à Genève (CNUCED, HCR, HCDH, OMS) et à New York (Assemblée générale de l'ONU, secrétaire général, Objectifs du Millénaire pour le développement, remise de la dette).

Dans certains cas, le COE peut devoir s'intéresser à des organisations intergouvernementales comme la Banque mondiale, le FMI et la Cour pénale internationale. Le COE se soucie également de coordination et de relations en réseau dans le cadre des Nations Unies et du Forum social mondial.

Au cours des trois prochaines années, le projet mettra plus particulièrement l'accent sur le désarmement nucléaire, la justice économique, les revendications des populations autochtones, la Cour pénale internationale et les questions qui surgissent dans la région géographique sur laquelle porte l'accent spécial annuel de la Décennie «vaincre la violence» 2001-2010.

On utilise un certain nombre d'instruments: déclarations et lettres ouvertes exprimant la position du COE et des Eglises; séminaires et réunions où les préoccupations sont analysées dans des perspectives éthiques et théologiques; Semaine d'action du COE auprès des Nations Unies à New York.