La formation oecuménique, de même que l'initiation à la foi aux niveaux communautaire et universitaire sont essentielles pour le renouvellement du mouvement oecuménique.  

Le COE offre à la fois la formation oecuménique elle-même et apporte son soutien aux Eglises, aux organisations et institutions oecuméniques qui fournissent la formation oecuménique et l'initiation à la foi, en les aidant à accroître leur capacité, à développer des programmes contextualisés et des méthodologies.