El CMI anima a las iglesias a llamarse unas a otras a la unidad visible, trabajar juntas por una misión en el mundo más fiel y aumentar la dimensión espiritual de sus vidas. Reconociendo que estas áreas están interrelacionadas, pretende hacerlo de manera integrada. 

Al tratar la unidad, la misión, la evangelización y la espiritualidad, este programa desempeña su labor, entre otras, a través de la Comisión de Fe y Constitución del CMI, la Comisión de Misión Mundial y Evangelización y de varias redes ecuménicas relacionadas al: racismo, la migración, los derechos y prioridades de los pueblos indígenas, los dalits y las personas discapacitadas. Proporcionan vínculos con muchas iglesias miembros y no miembros y organizaciones activas en estas áreas.